精確的預測病原的發生及流行趨勢，準確的鑑定危害植物的病原，明白剖析植物與病原相互之間的關係，及發展有效而不會損及人體及環境的病害防治方法，並配合現階段全國農業調整方案及國家經濟建設的需要，加強病原的非農藥防治及病原生態的研究，如單元抗體、交互保護及遺傳工程等技術，以解決重要的病害問題；配合環境保護，探究植物遭受有害氣體之傷害與生理機能之反應，以維護農作物的健康等。
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